Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1bQ0MW30 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms