Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kndc1Q0KK55 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms