Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc21bQ0HA38 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc21bQ0HA38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc21bQ0HA38 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc21bQ0HA38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc21bQ0HA38 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms