Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp2Q08652 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms