Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb2Q08331 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Calb2Q08331 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calb2Q08331 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Calb2Q08331 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calb2Q08331 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms