Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou6f1Q07916 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms