Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah1bQ06985 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1bQ06985 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms