Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CluQ06890 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CluQ06890 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CluQ06890 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CluQ06890 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CluQ06890 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CluQ06890 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CluQ06890 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CluQ06890 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CluQ06890 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CluQ06890 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms