Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox4Q06831 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms