Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms