Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Caprin2Q05A80 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Caprin2Q05A80 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms