Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r236Q05A06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms