Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fmn1Q05860 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fmn1Q05860 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fmn1Q05860 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms