Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rcn1Q05186 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rcn1Q05186 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms