Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms