Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox12Q04890 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms