Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk16Q04735 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk16Q04735 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms