Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smarcad1Q04692 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smarcad1Q04692 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms