Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RelaQ04207 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RelaQ04207 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RelaQ04207 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms