Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scg2Q03517 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms