Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkczQ02956 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkczQ02956 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkczQ02956 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkczQ02956 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkczQ02956 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkczQ02956 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms