Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcd1Q02242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd1Q02242 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms