Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkcqQ02111 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcqQ02111 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms