Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snai1Q02085 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snai1Q02085 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms