Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd1Q01822 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd1Q01822 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms