Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sec23aQ01405 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sec23aQ01405 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms