Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja5Q01231 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gja5Q01231 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja5Q01231 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms