Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col1a2Q01149 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a2Q01149 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms