Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb2Q00977 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb2Q00977 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb2Q00977 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms