Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp1Q00915 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp1Q00915 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms