Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itga4Q00651 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.1 ms