Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax8Q00288 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms