Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx2Q00262 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx2Q00262 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms