Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbp10Q000W5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp10Q000W5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms