Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shc1P98083 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms