Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33aP97950 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33aP97950 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33aP97950 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33aP97950 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33aP97950 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab33aP97950 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms