Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AlkP97793 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AlkP97793 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AlkP97793 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AlkP97793 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AlkP97793 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AlkP97793 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AlkP97793 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AlkP97793 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AlkP97793 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AlkP97793 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AlkP97793 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AlkP97793 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AlkP97793 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AlkP97793 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AlkP97793 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AlkP97793 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AlkP97793 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AlkP97793 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AlkP97793 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AlkP97793 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AlkP97793 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AlkP97793 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AlkP97793 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AlkP97793 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AlkP97793 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AlkP97793 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms