Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra1P97785 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra1P97785 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra1P97785 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms