Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ptprn2P80560 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ptprn2P80560 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ptprn2P80560 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptprn2P80560 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ptprn2P80560 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ptprn2P80560 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptprn2P80560 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms