Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctps1P70698 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctps1P70698 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms