Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb1P70662 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb1P70662 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms