Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp9xP70398 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9xP70398 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9xP70398 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9xP70398 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9xP70398 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms