Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shox2P70390 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shox2P70390 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shox2P70390 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shox2P70390 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms