Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad50P70388 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad50P70388 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms