Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf11P70378 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf11P70378 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms