Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms