Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms