Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps4xP62702 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps4xP62702 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms