Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrpd1P62315 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms