Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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